1. kolo, středa 30. 8. 2023, SA Poliklinika
Junior Chomutov – FŠ Litvínov
2:0
(0:0)
5. kolo, neděle 3. 9. 2023, SA Poliklinika
Junior Chomutov – FK Hvězda Cheb
6:1
(4:0)
6. kolo, sobota 9. 9. 2023, Máchovka
FK JUNIOR Děčín – Junior Chomutov
0:4
(0:3)
2. kolo, středa 13. 9. 2023, SK Vyžlovka
SK Vyžlovka – Junior Chomutov
2:2
(2:2)
7. kolo, neděle 17. 9. 2023, SA Poliklinika
Junior Chomutov – FK Varnsdorf
2:2
(0:1)
8. kolo, sobota 23. 9. 2023, ČZU Suchdol
SK Aritma Praha – Junior Chomutov
0:6
(0:3)
3. kolo, čtvrtek 28. 9. 2023, SA Poliklinika
Junior Chomutov – FK Baník Sokolov
1:4
(1:3)
9. kolo, sobota 30. 9. 2023, SA Poliklinika
Junior Chomutov – FK Viktoria Žižkov
1:11
(0:4)
10. kolo, sobota 7. 10. 2023, Ruzyně
FK Dukla Praha – Junior Chomutov
11:0
(7:0)
11. kolo, neděle 15. 10. 2023, SA Poliklinika
Junior Chomutov – VOŠ a SOŠ Roudnice nad Labem
3:1
(1:0)
12. kolo, sobota 21. 10. 2023, Sokol Byškovice
FK Neratovice-Byškovice – Junior Chomutov
3:2
(0:2)
13. kolo, neděle 29. 10. 2023, UMT u Moniky
Junior Chomutov – FK Baník Most - Souš
0:1
(0:1)
14. kolo, neděle 5. 11. 2023, SA Poliklinika
Junior Chomutov – ABC Braník
1:3
(1:1)
15. kolo, sobota 11. 11. 2023, Drahovice
FC Slavia Karlovy Vary – Junior Chomutov
7:0
(1:0)
16. kolo, neděle 3. 3. 2024, UMT u Moniky
Junior Chomutov – FK Arsenal Česká Lípa
1:1
(0:0)
17. kolo, neděle 10. 3. 2024, UMT Mikulova
FK Dukla Jižní Město – Junior Chomutov
3:1
18. kolo, neděle 17. 3. 2024, UMT Lomská
FŠ Litvínov – Junior Chomutov
3:4
(1:2)
19. kolo, neděle 24. 3. 2024
Junior Chomutov – SK Vyžlovka
1:0
(0:0)
20. kolo, sobota 30. 3. 2024
FK Baník Sokolov – Junior Chomutov
5:2
21. kolo, neděle 7. 4. 2024
Junior Chomutov – SK Střešovice 1911
4:4
22. kolo, neděle 14. 4. 2024
FK Hvězda Cheb – Junior Chomutov
5:1
23. kolo, neděle 21. 4. 2024
Junior Chomutov – FK JUNIOR Děčín
3:1
(2:0)
24. kolo, neděle 28. 4. 2024, Jiřetín pod Jedlovou
FK Varnsdorf – Junior Chomutov
2:3
(1:2)
4. kolo, středa 1. 5. 2024, UMT Střešovice
SK Střešovice 1911 – Junior Chomutov
3:3
(1:1)
25. kolo, neděle 5. 5. 2024, SA Poliklinika
Junior Chomutov – SK Aritma Praha
2:5
(2:2)
32. kolo, středa 8. 5. 2024
Junior Chomutov – FC Slavia Karlovy Vary
2:3
(1:2)
26. kolo, sobota 11. 5. 2024
FK Viktoria Žižkov – Junior Chomutov
5:3
(2:3)
27. kolo, neděle 19. 5. 2024
Junior Chomutov – FK Dukla Praha
0:8
(0:4)
28. kolo, sobota 25. 5. 2024
SK Roudnice nad Labem – Junior Chomutov
4:2
(2:0)
33. kolo, středa 29. 5. 2024
FK Arsenal Česká Lípa – Junior Chomutov
0:4
(0:1)
29. kolo, neděle 2. 6. 2024
Junior Chomutov – FK Neratovice-Byškovice
2:2
(1:1)
30. kolo, sobota 8. 6. 2024
FK Baník Most - Souš – Junior Chomutov
4:0
(1:0)
34. kolo, středa 12. 6. 2024
Junior Chomutov – FK Dukla Jižní Město
3:2
(1:1)
31. kolo, sobota 15. 6. 2024
ABC Braník – Junior Chomutov
2:0
(1:0)